13曰疫情通报；疫情13日最新数据消息

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上海低风险地区哪几个

上海部分地区为高风险或中风险，大部分地区为低风险。具体情况如下：高风险地区：黄浦区南京东路街道西藏中路180号高盛商厦5楼的HD PUB汉登喝酒公司人民广场店。中风险地区：包括宝山区罗店镇的市一路231233号、竹巷街95弄，杨行镇的红林路576弄和家欣苑B区东区等多个区域。

根据2022年1月13日15：18：03的最新数据，上海全境均为低风险地区。这意味着当前上海没有被划分为中风险或高风险区域。上海各区域的疫情风险等级自始至终保持在低风险状态。

上海市低风险地区如下：静安区芷江西路街道(中风险区除外)。松江区佘山镇（中风险区除外）。浦东新区浦兴路街道（高风险区除外）。黄浦区小东门街道(中风险区除外)。

吉林疫情原因:为什么突然这么严重

1、吉林疫情的突然加重，主要是由以下几个因素造成的：首先，奥密克戎变异株BA.2的高传染性和隐匿性是关键因素。这个变种比原始的奥密克戎毒株更为致命，传播速度更快，一些感染者在感染一天后就具有传染性，且症状往往不明显，这导致了大量无症状感染者的存在，使得防控工作更为困难。

2、由于这些特性，病毒在早期难以被发现，容易在社区中传播。另一方面，这也显示出一些地区在应对疫情快速上升时，医疗资源的扩容和应急处置能力不足，导致短时间内集中收治能力受限。 张艳还指出，一些地区对于奥密克戎病毒的特性和复杂严峻的疫情形势认识不足，研判不准确。

3、首先，吉林疫情的突然爆发并非一蹴而就，而是新冠病毒在该地区隐匿传播了一段时间。政府在疫情管理上的疏漏导致了此次疫情的大规模爆发。若非吉林农业科技学院疫情在网络上引发广泛关注，吉林的疫情可能还处于隐匿状态，对当地的影响可能更为深远。

rnaseq数据分析

RNA-seq（RNA测序）是一种先进的转录组研究技术，它利用高通量测序平台来直接测量细胞中的RNA分子数量。这种技术能够提供关于基因表达的定量信息，包括未知基因的发现、已知基因的表达水平变化、以及可变剪接事件等。

fastq文件的格式为*.fastq，存储了测序数据。文件中包含了每个测序读取的碱基质量和质量得分，通过特定的编码方法表示碱基的准确度。质量得分通过计算误差概率得到，以确保数据质量和可读性。在进行实验前，需要准备注释文件和基因组文件，这些文件将帮助后续的分析工作。

在进行Bulk-RNAseq数据分析时，首要步骤是使用STAR和Rsubread软件进行比对和定量，最终目的是获取counts文件。首先，需要在服务器上安装Anaconda，然后下载并安装STAR。在安装成功后，需要构建基因组索引文件，这需要提供基因组的fa文件和注释的gtf文件。通过输入命令，可以构建所需的索引文件。

RNA-Seq原始数据质量控制(QC)是非常重要的一个环节，由于各种原因，例如测序平台、实验操作等，原始测序数据可能存在不少问题，如低质量读段、接头序列、污染序列等。为了确保后续分析的准确性，需要先进行质量控制。

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